1882 में पंजाब विश्वविद्यालय एक विशेष निगमन अधिनियम द्वारा स्थापित हुआ, और 1887 में एक अन्य विशेष निगमन अधिनियम ने इलाहाबाद में पाँचवाँ भारतीय विश्वविद्यालय स्थापित किया। इन दो विशेष निगमन अधिनियमों का सामान्य ढाँचा 1857 के अधिनियमों के समान था, यद्यपि पंजाब और इलाहाबाद विश्वविद्यालयों के सीनेटों को प्राध्यापकों और व्याख्याताओं की नियुक्ति करने या उसकी व्यवस्था करने की शक्ति दी गई, एक विशेषाधिकार जो निगमन अधिनियमों ने 1857 में पहले तीन विश्वविद्यालयों कलकत्ता, बंबई और मद्रास को नहीं दिया।

पहले तीन विश्वविद्यालय जानबूझकर केवल परीक्षक विश्वविद्यालय बनाने का इरादा रखे गए थे, उसी तरह और उसी मॉडल पर जैसे तत्कालीन लंदन विश्वविद्यालय।

इससे 1854 के शिक्षा डिस्पैच के एक महत्वपूर्ण सुझाव की उपेक्षा हुई, जिसने विभिन्न ज्ञान-शाखाओं में व्याख्यान देने हेतु प्राध्यापक-पदों की संभावित स्थापना का सुझाव दिया था, जिनकी प्राप्ति हेतु, कम से कम उन्नत स्तर पर, भारत के अन्य संस्थानों में तब सुविधाएँ नहीं थीं। जब लाहौर और इलाहाबाद को यह विशेषाधिकार क्रमशः 1882 और 1887 में मिला, तो भारतीयों ने इसे कलकत्ता, बंबई और मद्रास तक बढ़ाने की माँग की, पर विश्वविद्यालयों से निकटता से जुड़े यूरोपीय अधिकारियों ने दो आधारों पर इसका विरोध किया।